大连医科大学附属第二医院器官移植中心成立于2001年，是国家卫健委批准的肝移植、肾移植、心脏移植、肺移植国家定点准入医院，也是全国为数不多同时开展多种器官移植的中心。目前已成功完成肝脏移植300余例，手术成功率及远期存活率均达到国内先进水平，曾获辽宁省科技进步三等奖。同时，完成肾移植术百余例，开展的高难度小儿及亲属活体肾移植术、胰肾联合移植术、活体肾移植术等多项技术填补了大连市乃至辽宁省空白。2021年，中心成功完成异体双肺移植术，自主完成心脏移植手术，实现了大连市以及辽南地区肺脏、心脏移植的历史性新突破。中心在大连率先开展公民逝世后捐献（DCD）供体器官移植工作，成为辽宁省仅有的两家人体器官获取组织（OPO）中心之一，每年成功协调DCD器官捐献数十例。